2010年6月2日 星期三

enhancer RNAs!!

Nature(2010)465:182

其實早期關於RNA polymerase II的研究就已經顯示了,RNA polymerase II本身是沒有很強的專一性。而在現在這個後RNAi的時代,出現個什麼新的non-coding RNA實在不能算是驚天動地的新聞。但是依舊是非常有趣的發現,這篇研究藉由gemone wide的Chip-seq跟RNA-seq,發現其實RNA polymerase II會直接bind在enhancer上,更重要的是,它還真的會轉錄出RNA來,作者們把這類型的RNA稱為eRNA (enhancer RNA),大小最長到2KB,eRNA不像是真正的transcription start site,它是沒有方向性的,enhancer兩邊的序列都會被轉錄。

eRNA有沒有任何作用,未知

我個人是認為這篇不會動搖central dogma,但是卻顯示了,轉錄機制並沒有如想像中的簡單。

傳統上我們會認為RNA PolII藉有各種factors bind到DNA上然後開始轉錄RNA
Michael Levine之前的paper顯示了在發育的過程中,RNA PolII其實很早就已經就定位了,
但是卻沒有立刻開始轉錄,而是坐在那裏等待適當的訊號。

而這篇文章讓整個故事更加複雜,目前eRNA的dat不多,
但基於enhancer跟promoter在轉錄的時候,理論上會被TF連在一起。
目前我傾向認為eRNA只是non-specific trasncription



沒有留言:

張貼留言